Tokyobörsens Nikkei 225-index sjönk 0,5 procent, medan det bredare Topix-index gick ned 0,6 procent. Vinsthemtagningar inför den japanska långhelgen låg bakom den negativa trenden.
Samtidigt kom ett nytt inköpschefsindex från Japan, som pekar på en fortsatt nedgång för landets industri trots en uppgång jämfört med motsvarande index i juni.
Taiwanbörsen steg samtidigt 0,6 procent, medan Seoulbörsens Kospi-index låg på plus 0,1 procent i den avslutande handeln.
Shanghaibörsen låg på en uppgång på 0,8 procent, medan Hongkongbörsens Hang Seng-index låg på minus 0,3 procent.