– Osäkerheten om USA-valet har faktiskt ökat, säger Daiju Aoki, regional chef på UBS Securities i Japan efter debatten.
Liksom många andra bedömare ser han en stor risk för ett oklart valresultat som resulterar i en utdragen rättslig strid mellan den sittande presidenten och utmanaren.
Nikkei 225-index föll 1,5 procent, medan det bredare Topix-index backade 2 procent. Utvecklingen låg i linje med nedgångar i terminshandeln inför onsdagens handel på Wall Street.
På andra stora asiatiska börser var dock stämningen inte lika dyster.
Taiwanbörsen steg 0,4 procent och Seoulbörsens Kospi-index låg på plus 0,9 procent i den avslutande handeln.
Det var även uppåt på Hongkongbörsen inför stängning, plus 0,7 procent, medan Shanghaibörsen låg på minus 0,1 procent.