Nikkei 225-index sjönk 1,1 procent medan det bredare Topix-index backade 0,8 procent.
Hongkongs Hang Seng-index och Shanghaibörsens kompositindex ökar båda 0,2 procent i den sena handeln.
Taiwans Weighted index stängde på plus, upp 1,3 procent.
Seoulbörsens Kospi-index lyfte 0,3 procent.