Nedgången var större än väntat. Analytiker hade i snitt räknat med en prisnedgång på 0,1 procent.
Även i månadstakt var nedgången 0,4 procent mot väntade minus 0,1 procent.
Tysklands konsumentprisindex för september sjönk med 0,2 procent i årstakt och lika mycket i månadstakt, enligt statistikbyrån.
Nedgången var tydligast för energipriser, som föll 7,1 procent i årstakt. De tyska livsmedelspriserna steg 0,6 procent i årstakt.