Fyra ungdomar hade placerat sig längst bak i föreläsningssalen.
Precis när ambassadören Benjamin Dagan inledde sitt föredrag reste de sig upp och ropade "Gaza, Gaza- solidaritet".
Polisen förde bort de tre unga männen och kvinnan.
Några i publiken började applådera och skandera protester mot Israels politik. Ytterligare en man leddes då ut av polisen.
Vid ett par tillfällen under ambassadörens föredrag uttryckte publiken sin ilska och frustration men följde konferenciern Hans Westerberg tillrättavisningar.
- Behåll skorna på. Vi vill inte ha en upprepning av vad som hände på Stockholms universitet. Om ni vill vara kvar i salen får ni lyssna och vara tysta och ställa frågor efteråt.
När polisen förde ut de omhändertagna personerna blev stämningen spänd i entréhallen. Flera personer ifrågasatte polisens ingripande och någon skrek: "Vad håller ni på med?". Polisen tvingades släpa ut en av de omhändertagna männen.
Israels ambassadör möttes av ett 50-tal uniformerade och civilklädda poliser när han anlände Linköpings universitet.
Oro fanns för att onsdagens attack mot Benny Dagan, skulle upprepa sig. Två personer attackerade då honom med en sko och böcker.
- Israels ambassadör är här för att tala om krisen men det är ingen kris, det är ett folkmord som pågår, förklarade Tom för Nätverket mot Krig och Arbetarklass.se.
Det var dessa nätverk som arrangerade demonstrationen för att protestera mot Benny Dagans besöket.
Skulle du kunna kasat en sko på ambassadören, som man gjorde i Stockholm?
- Nej, men jag har förståelse för de personer som gjorde så i Stockholm.
Döda barn
På plats på universitet fanns också ett stort antal palestinier som var missnöjda över att Utrikespolitiska studentföreningen bjudit in en representant för Israel.
Med bilder på döda barn i händerna ställde de sig utmed den långa kön till föreläsningssalen.
- Jag tycker inte man ska bjuda in representanter från ett land vars ledare ska ställas inför rätta i Haag", sa Hassan Amro, från Palestinska föreningen.
Flera banderoller hade anti-israeliska budskap som till exempel "Dracula = Israel".
När Benjamin Dagan med raska steg klev in hörsalen, omgiven av en ring av livvakter från Säkerhetspolisen och uniformerade poliser skanderade motdemonstranterna "Shame, shame, shame".
När mötet avslutades bildade polisen en korridor där Benjamin Dagan kunde gå utan att bli fysiskt angripen.
Han möttes av högljudda burop och obscena gester när han lämnade hörsalen. Motdemonstranterna skrek: "Ord tvättar inte blod". Ambassadören tittade inte på motdemonstranterna och verkade opåverkad av uppståndelsen.
Polisen upprättade en anmälan om hets mot folkgrupp eftersom det på en av motdemonstranternas banderoller fanns hakkors.
De fem gripna förts till polishuset men släpptes efter mötet. De är inte misstänkta för något brott.
En av de omhändertagna, Fredrik Åslund, hörde under kvällen av sig till Corren och ville berätta varför agerat.
- Vi var några personer som ville visa vår avsky för att man så nära inpå en massaker låter en person stå oemotsagd som bara representerar en sida.
- Ambassadören sa att i ett öppet samhälle tar man inte till våld. Det tycker jag är ironiskt med tanke på det som har hänt i Palestina.