Orsaken var ett tekniskt fel som gjorde att den så kallade transpondern slogs av.
Händelsen rapporterades av divisionschefen, som tycker att den "känns som ett allvarligt systemfel", skriver Norrländska Socialdemokraten.Saab utreder nu vad som gått snett.
Transponderns funktion är att sända information om planets position till flygledningen på marken och till andra plan för att undvika kollisioner.