Tanken var att Ad Mandatum skulle utvidga sin verksamhet på Karin Boye-skolan som i dag har elever från klass sju till nio från och med höstterminen 2007.
Men enligt Skolverket uppfyller inte ansökan de villkor för godkännande och rätt till bidrag som krävs.
Bland annat nämns att sökanden inte redovisat en tillförlitlig elevprognos som ska kunna visa på hur många elever som kan tänkas söka till den nya verksamheten.
Skolverket bedömer inte heller Ad Mandatums budget som tillförlitlig då de endast presenterat en resultatbudget för första verksamhetsåret.
Hans Lindman, delägare i Ad Mandatum, tycker att Skolverket ställer orimliga krav på friskolorna.
- Deras regelverk är förra regeringens hållning mot friskolorna, säger han.
Lindman anser inte att Skolverket har rätt i sitt beslut och poängterar att företaget visst presenterat underlag för en längre verksamhetsperiod, underlag som Skolverket slarvat bort.
- Vi kommer inte att överklaga och inte komplettera det här utan skicka in en ny ansökan den första april i år.
Ad Mandatum vill fortfarande utöka Karin Boye-skolans verksamhet men Hans Lindman säger att man inte längre har för avsikt att starta allt på en och samma gång.
Vilket som ska komma först, förskoleklassen eller grundskola årskurs ett till sex, kan han inte säga i nuläget.