Flaggan hängde från Rådhusets trappa efter firandet. En person blev vittne till hur tre personer gick upp för trappan och slet ned flaggan.
När de kommit ned hällde en av dem en vätska på flaggan och tände på. Vittnet uppger att de båda andra applåderade.
Flaggan, som ägdes av Vadstena kommun, blev till hälften uppeldad.
Detta är bara ett av de många fall av skadegörelse i Motala och Vadstena som anmäldes till polisen under tisdagen.
Skadegörelse har i år varit betydligt vanligare i Motala än i resten av Östergötland. Det framgår av färsk statistik. Till och med maj har 7 fall av skadegörelse anmälts i Motala per 1 000 invånare, att jämföras med 5,6 för hela länet och 4,8 för Vadstena.