Vid klockan 18.46 stoppades tågtrafiken mellan Nässjö och Bodafors, enligt Trafikverket.
Anledningen ska ha varit en viltolycka.
Trafikverket bedömde att 30 stationer kunde komma att påverkas, där bland annat Linköping och Norrköping.
Strax efter klockan 20 på onsdagskvällen meddelade Trafikverket att tågtrafiken hade återupptagits men att vissa förseningar kan kvarstå.