Inrikesflyget, en Airbus 320 från libyska Afriqiyah Airways, var på väg till huvudstaden Tripoli i december 2016 när de två männen hotade att spränga planet och tvingade besättningen att flyga till Malta. Kaparna gav upp efter fyra timmar på maltesisk mark. Deras vapen visade sig då vara attrapper.
Den dömde erkände brottet på tisdagen, medan hans misstänkte kumpan förnekar brott.
Ingen skadades fysiskt i samband med kapningen.