Attacken genomfördes i mörkret innan gryningen, enligt landets militärchef, som i ett uttalande sade att attacken riktats mot en station i Inata i provinsen Soum.
Säkerhetsminister Maxime Koné sade på nationell radio att dödstalet fortfarande var preliminärt och att en civil person också hade dödats.
Myndigheter misstänker initialt att en extremistisk islamistgrupp ligger bakom attacken.