Bland de skadade finns ett barn och två journalister.
Polis använde bland annat tårgas för att skingra de regeringskritiska demonstranterna som hade tagit sikte på ett torg i centrala Ouagadougou.
Motståndare till president Roch Kaboré manar till nya protester som svar på det ökande antalet jihadistiska attacker i landet.