Beskedet kommer efter våldsamheterna mellan fångar på fängelset i hamnstaden Guayaquil som krävde minst 118 liv. Ytterligare 86 skadades, för sex av dem uppges tillståndet vara kritisk, enligt Ecuadors fängelsemyndighet.
Sammandrabbningarna mellan rivaliserade gäng i fängelset, som startade i tisdags, är den senaste av flera liknande händelser i Ecuador där totalt 237 fångar har dödats hittills i år – att jämföra med totalt 103 år 2020.
Hittills har 41 av offren i Guayaquil kunnat identifieras.
Polisen tog kontroll över fängelsekomplexet på torsdagskvällen efter en massiv säkerhetsinsats som involverade cirka 900 poliser och med soldater och stridsvagnar på plats utanför.
Ecuadors fängelseväsende innefattar ett 60-tal anläggningar anpassade till omkring 30 000 fångar. Men omkring 39 000 personer sitter inne, av dem 8 500 på Guayaquil-fängelset.
Under fredagens presskonferens meddelade fängelsemyndighetens chef Bolívar Garzón att cirka 2 000 intagna över 65 år, eller med dålig hälsa, kommer att friges i ett försök att minska trängseln på fängelserna.