Detta sedan preliminära resultat från en mindre studie antyder att vaccinet ger minimalt skydd mot lindriga former av den sydafrikanska variant av covid-19 som dominerar i landet.
Studien, som inte är granskad, ska publiceras på måndag.
Sydafrika planerade att inom kort inleda vaccinering med Astra Zenecas vaccin efter att ha mottagit en miljon doser. I stället kommer nu vaccin utvecklade av Johnson & Johnson och Pfizer-Biontech att användas.
Hälsominister Zweli Mkhize säger att regeringen kommer att avvakta vidare besked från forskarvärlden om Astra Zenecas vaccin.