Den hårdföre tidigare presidenten greps efter att ha anlänt från Hongkong och har enligt sittande president Ferdinand Marcos kansli gripits på order av Internationella brottmålsdomstolen i Haag (ICC).
ICC, som bekräftar gripandet, har utrett expresidenten för brott mot mänskligheten i samband med det som kallats för Dutertes "krig mot droger", då tusentals människor dödades i polisens blodiga gaturäder riktade mot såväl misstänkta brukare som narkotikahandlare.
ICC började utreda morden redan 2011 då Duterte var borgmästare i staden Davao. 2019, under sin tid som president, såg Duterte sedan till att Filippinerna rev upp Romstadgan, grunddokumentet som binder länder att följa ICC:s ordrar.
Men utredningen vid domstolen har fortsatt i flera turer och togs upp igen i juli 2023.
President Ferdinand Marcos som efterträdde Duterte 2022 har inte återanslutit sig till Romstadgan, men sagt att man kan komma att gripa expresidenten om Interpol utfärdar en begäran om ett gripande.
Redan under tisdagen sattes expresidenten på ett flyg till Haag. I ett filmklipp hans dotter Veronica Duterte har publicerat på sociala medier säger ex-presidenten till de myndighetspersoner som eskorterade honom till ett väntande flygplan att:
– Visa mig den juridik som ligger till grund för att jag befinner mig här. Ni kommer att ställas till svars för inskränkningen av min frihet.
Duterte är fortfarande populär bland sina anhängare i Filippinerna. Han kandiderar för att återta sitt jobb som borgmästare i Davao i maj.