Moskva anklagar motparterna för att inte försöka slå fast vad som verkligen hände och säger att utredningen är partisk och politiserad och avfärdar vidare samtal.
Nederländernas utrikesminister Stef Blok säger att det ryska beslutet är ensidigt och mycket beklagligt.
– Det är extremt smärtsamt för de efterlevande, säger han.
MH17 var på väg från Amsterdam till Kuala Lumpur den 17 juli 2014 när det träffades av en BUK-robot avfyrad från ett territorium i Ukraina som ockuperats av proryska rebeller. Samtliga ombord omkom, varav huvuddelen var nederländska medborgare.
Internationella utredare slog för två år sedan fast att roboten kunde knytas till ett ryskt militärförband. Tre ryssar och en ukrainare som anklagas för att ha varit inblandade i att ta roboten till Ukraina har åtalats i Nederländerna i sin frånvaro.
Nederländerna har också stämt Ryssland vid den Europeiska domstolen för mänskliga rättigheter i frågan.
Ryssland har hela tiden nekat till anklagelser om inblandning i att ha skjutit ned MH17.