Adnan al-Afiyuni, mufti för Damaskus-regionen, dödades när en bilbomb exploderade utanför Damaskus, enligt den statliga nyhetsbyrån Sana.
Det oppositionella Syriska människorättsobservatoriet (SOHR), som bevakar kriget i Syrien från Storbritannien, har sagt att Adnan al-Afiyuni spelat en nyckelroll för att nå uppgörelser med rebellgrupper i ytterområdena av Damaskus under kriget.
Det finns inga uppgifter om vilka som ligger bakom bilbomben.
Under torsdagen rapporterade även SOHR om att en drönarattack genomförts mot jihadister i provinsen Idlib i de nordvästra delarna av landet. I attacken dödades 14 jihadister, varav sex ledare.
Fem av de dödade var inte syriska medborgare, enligt SOHR-chefen Rami Abdel Rahman. Det är inte klart vilka nationaliteter det rör sig om.
Några timmar senare bekräftade USA:s försvars centralkommando (Centcom) att de ligger bakom den drönarattacken.