En domare beordrade på söndagen att mannen skulle läggas in på en psykiatrisk avdelning.
Attacken inträffade i lördags på tåget mellan städerna Regensburg och Nürnberg. Mannen knivskar fyra män, varav två fortfarande vårdas på sjukhus.
Motivet till attacken är oklart. Mannen är bland annat misstänkt för mordförsök.
27-åringen, som är syrisk medborgare, har berättat att han känt sig förföljd av polisen ett tag och att han angrep den första mannen eftersom han trodde att passageraren skulle döda honom.
Attackerna på de andra passagerarna ska ha skett "som i en dröm", säger Gerhard Neuhof.