Samlingen, som omfattar 240 fåglar, har varit deponerad hos Bengtssons Bygg i Vadstena som visat fåglarna i Tåkernrummet för allmänheten.
Men sedan två år visas de inte längre och Bengtssons Bygg har sagt upp avtalet med kommunen.
Läroverksläraren adjunkt VA Engholm skapade samlingen under andra halvan av 1800-talet eftersom han trodde att Tåkern skulle torrläggas för gott.
Tidigare har fåglarna funnits i Petrus Magni skola.
- De är förvånansvärt välbevarade med tanke på att de är så gamla, säger ornitologen Christer Elderud. Det rör sig om en av Sveriges mest speciella samlingar genom att den är så väl sammanhållen.
Frågan om fågelsamlingen skulle kunna placeras i Tåkerns blivande naturrum anses vara alltför tidigt väckt.