"Så tacksam som jag är känner jag att jag inte kan acceptera det här priset ensam. Jag känner inte att jag åstadkommit någonting själv den här säsongen, eller egentligen i hela min karriär", säger Henderson i ett uttalande.
Manchester Citys Kevin De Bruyne, Manchester Uniteds Marcus Rashford och två av Hendersons lagkamrater i Liverpool, Virgil van Dijk och Sadio Mane, skuggade den 30-årige britten i omröstningen.
Efter ligasäsongen, som avslutas på söndag, kommer även den engelska spelarorganisationen PFA med sitt pris till årets spelare.