Villareal-anfallaren Gerard Moreno prickade in ledningsmålet på straff redan i den sjätte minuten.
Efter en dryg halvtimme var det Real Sociedads tur att få en straff. Mikel Oyarzabal stegade fram och utjämnade till 1–1, vilket också blev slutresultatet.
Alexander Isak, som startade i torsdagens Europa League-match mot AZ Alkmaar, blev kvar på bänken under hela matchen.