Mitt under ett styrelsemöte träffade sju skott förbundets lokaler i Istanbul. Ingen uppges dock ha skadats när skotten avlossades av ännu okända gärningsmän.
En talesman för landets styrande parti AKP uppger att han var i telefon med den turkiske fotbollsförbundsordföranden Mehmet Büyükeksi när skjutningen ägde rum.
"Polisen kommer att avslöja alla detaljer senare", säger presstalesman Omer Celik till pressen.
"Jag fördömer starkt den väpnade attacken mot det turkiska fotbollsförbundets administrationsbyggnad i Riva. En storskalig utredning har inletts angående attacken", kommenterar Istanbuls guvernör Ali Yerlikaya i sociala medier.